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DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可滅活各種蛋白質(zhì),是RNA酶的強(qiáng)抑制劑。原位雜交在雜交及其以前的各步處理中,所有液體試劑都應(yīng)經(jīng)DEPC處理。 在做RNA提取實(shí)驗(yàn)時(shí),實(shí)驗(yàn)器具要用“DEPC水"處理過,溶液一般都要用"DEPC處理水"來配制。
DEPC處理水
DEPC處理水即RNAase-free ddH2O, 配制方法是:取市售DEPC 1ml,加入1L待處理水(蒸餾水等)中(即終濃度含0.1% DEPC的水),經(jīng)猛烈振搖后,于室溫靜止數(shù)小時(shí),然后高壓滅菌,以除去降解DEPC(DEPC分解為CO2和乙醇)。
注意:①DEPC是一種潛在的致癌物質(zhì),在操作中應(yīng)盡量在通風(fēng)的條件下進(jìn)行,并避免接觸皮膚。②含有Tris緩沖液的溶液中,不能加入DEPC。
DEPC水
DEPC水是指終濃度含0.1% DEPC的水,在1000ml雙蒸水中加入DEPC原液1ml,然后搖勻過ye
產(chǎn)品使用常見誤區(qū)
誤區(qū)1
重復(fù)使用含DEPC的水處理:
由于DEPC較貴,而且書上說DEPC要用高壓滅菌處理去除,于是有些人就萌發(fā)了重復(fù)使用DEPC的想法,即對(duì)含有DEPC的水不進(jìn)行高壓滅菌,從而重復(fù)使用含DEPC的水處理槍頭、離心管等。節(jié)約本是好事,但這樣的節(jié)約是無效的。因?yàn)?/SPAN>DEPC在水溶液中不穩(wěn)定,極易分解,DEPC在pH6.0和pH7.0的PBS緩沖液中的半衰期分別約為20min和10min,DEPC在水中的半衰期約為30min。因此,重復(fù)使用含DEPC的水不能保證實(shí)驗(yàn)的RNase-free。
誤區(qū)2
溶液中DEPC含量越高,滅活效果越好:
這個(gè)誤區(qū)錯(cuò)了一半,的確1% DEPC能滅活高達(dá)1000ng/ml的RNase A,而0.1% DEPC只能滅活少于500ng/ml的RNase A。但是溶液中殘留的DEPC副產(chǎn)物會(huì)抑制一些酶反應(yīng),因此DEPC含量越高,高壓滅菌后的DEPC副產(chǎn)物就越多,抑制越明顯。
誤區(qū)3
必需長(zhǎng)時(shí)間高壓滅菌來*去除DEPC:
用DEPC處理過的溶液,在15-20min的高壓滅菌后還可以聞到一股特殊的香味,因此有人認(rèn)為高壓滅菌去除DEPC不*,所以要延長(zhǎng)高壓滅菌的時(shí)間以*去除DEPC。但是延長(zhǎng)高壓滅菌的時(shí)間并不需要,因?yàn)槁劦降奶厥庀阄恫皇?/SPAN>DEPC的,而是DEPC分解產(chǎn)物之一的乙醇同溶液中殘留的微量的羧酸(如甲酸和乙酸等)反應(yīng)產(chǎn)生的揮發(fā)性脂類。這種特殊的水果香味不代表有痕量的DEPC殘留。
北京索萊寶公司長(zhǎng)期提供DEPC水和DEPC處理水兩種產(chǎn)品,貨號(hào)分別是D8210和R1600.特別是DEPC處理水可以直接用于實(shí)驗(yàn)耗材的RNA酶的清除作用。
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